- 所办公室（保密办）
- 党委办公室（纪委办公室）
- 人事处（国际合作处）
- 科研处（成果管理办公室）
- 计划财务处
- 离退休干部服务处
- 保卫处
- 战略与政策研究中心
- 重点科技领域研究中心
- 未来科技研究中心
- 区域发展与企业创新研究中心
- 科学计量与评价研究中心
- 信息资源中心（国家工程技术图书馆）
- 情报理论与方法研究中心
- 科技报告服务与研究中心
- 科技信息综合利用与公共服务中心
- 国家科技计划管理支撑中心
- 信息技术与网络中心
- 研究生部
- 科学技术委员会
- 学术委员会
- 全国信息与文献标准化技术委员会
- 中国科学技术情报学会
- 中国软科学研究会
科技部系统
资源服务系统
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